Sinopse

Após a tentativa falhada do NERV de recuperar as Lanças de Longinus e realizar o Projeto Instrumentalidade Humana, a destruição causada pelo Quarto Impacto foi amplamente evitada. Em um estado de desordem, Shinji Ikari, Asuka Langley Shikinami e Rei Ayanami viajam para a Vila 3, um assentamento de sobreviventes livre da ruína da Terra. Lá, Shinji lentamente chega a um acordo com seu passado, desenvolvendo uma vida completamente diferente de seus dias como piloto Evangelion. Enquanto isso, Nerv faz preparativos para continuar o Projeto Instrumentalidade por meio de um novo Impacto. Quando o principal couraçado aéreo de WILLE chega à aldeia, Shinji decide embarcar, acreditando que pode ajudar pilotando um Evangelion. À medida que novos segredos são descobertos e uma batalha entre WILLE e Nerv se aproxima, o futuro da Terra está em jogo. Shinji pode salvar a humanidade e o resto do mundo uma última vez? [Escrito por MAL Reescrever]